Suomen Muinaismuistosäätiön sr hallitukseen kuuluu viisi jäsentä, joiden toimikausi kestää kerrallaan kolme vuotta.
Uusi hallitus aloitti toimintansa kesäkuun alussa pitämällä ensimmäisen kokouksensa. Tuolloin hallituksen puheenjohtajaksi valittiin Maria Vanha-Similä ja varapuheenjohtajaksi Johanna Enqvist. He, kuten hallituksen jäsenet Elina Räsänen ja Liisa Seppänen, olivat mukana jo säätiön edellisessä hallituksessa. Uutena hallitukseen valittiin Laura Tuominen.
Säätiön hallitus kokoontuu tavallisesti noin 5–6 kertaa vuodessa. Kokouksissa päätetään esimerkiksi säätiön hallussa olevan metsäomaisuuden ja sijoitusten asioista sekä jaetaan vuosittain avustuksia säätiön edustamien tieteenalojen aiheita käsitteleville tutkijoille ja toimijoille.
Säätiön sääntöjen mukaan hallituksen toimikausi on kolme vuotta ja puheenjohtaja valitaan vuodeksi kerrallaan kunkin vuoden ensimmäisessä kokouksessa. Hallituksen valinnan suorittaa Suomen Muinaismuistoyhdistys ry. siten, että säätiön hallituksessa tulee olla mukana myös yhdistyksen hallituksessa mukana olevia henkilöitä. Hallituksen esittelijänä ja sihteerinä toimii säätiön edustaja Jussi Lehtonen.

